Он достиг замечательных успехов во внедрении результатов своих исследований в практику школы. Созданный им учебник по чтению для малограмотных выдержал 15 изданий. Широкую известность получили также его учебники для сельских школ рабочей молодежи и для национальных школ.
С момента основания Академии педагогических наук (с 1944 г.) Д. Н. Богоявленский начинает свою основную исследовательскую работу по проблемам усвоения орфографии в школе. Его многолетние исследования в этой области были обобщены в монографии «Психология усвоения орфографии» (1957), которая выдержала два издания и была удостоена первой премии им. К.Д. Ушинского.
За этот труд ему была присвоена степень доктора педагогических наук, звание профессора.